Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FYCO1Q9BQS8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.18
FYCO1Q9BQS8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FYCO1Q9BQS8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms