Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT12Q99456 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT12Q99456 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT12Q99456 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms