Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R9BQ96SB3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPP1R9BQ96SB3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPP1R9BQ96SB3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms