Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC4A9Q96Q91 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC4A9Q96Q91 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC4A9Q96Q91 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms