Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRELD1Q96HD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRELD1Q96HD1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms