Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHFRQ96EP1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms