Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nsl1Q8K305 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nsl1Q8K305 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nsl1Q8K305 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms