Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8BGC1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8BGC1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8BGC1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8BGC1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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