Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna12Q80SS5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna12Q80SS5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms