Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ckap2lQ7TS74 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ckap2lQ7TS74 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ckap2lQ7TS74 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms