Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
HECW1Q76N89 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HECW1Q76N89 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms