Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF7Q6Q0C0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF7Q6Q0C0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms