Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4galnt3Q6L8S8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4galnt3Q6L8S8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4galnt3Q6L8S8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms