Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmcc1Q69ZZ6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tmcc1Q69ZZ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms