Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STRIP1Q5VSL9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STRIP1Q5VSL9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms