Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l2Q3UXB0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mbd3l2Q3UXB0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms