Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Arfgef3Q3UGY8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arfgef3Q3UGY8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms