Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF1AQ15573 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF1AQ15573 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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