Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TROQ12816 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TROQ12816 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TROQ12816 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TROQ12816 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TROQ12816 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TROQ12816 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TROQ12816 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TROQ12816 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TROQ12816 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TROQ12816 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TROQ12816 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TROQ12816 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TROQ12816 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TROQ12816 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TROQ12816 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TROQ12816 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TROQ12816 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TROQ12816 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TROQ12816 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TROQ12816 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TROQ12816 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TROQ12816 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TROQ12816 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TROQ12816 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TROQ12816 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TROQ12816 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TROQ12816 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TROQ12816 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TROQ12816 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TROQ12816 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TROQ12816 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TROQ12816 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
TROQ12816 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TROQ12816 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TROQ12816 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TROQ12816 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TROQ12816 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TROQ12816 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TROQ12816 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TROQ12816 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TROQ12816 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TROQ12816 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TROQ12816 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TROQ12816 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TROQ12816 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TROQ12816 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TROQ12816 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
TROQ12816 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TROQ12816 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TROQ12816 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TROQ12816 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TROQ12816 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TROQ12816 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TROQ12816 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TROQ12816 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TROQ12816 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TROQ12816 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TROQ12816 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TROQ12816 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TROQ12816 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TROQ12816 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TROQ12816 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TROQ12816 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TROQ12816 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TROQ12816 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TROQ12816 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TROQ12816 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TROQ12816 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TROQ12816 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TROQ12816 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TROQ12816 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TROQ12816 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TROQ12816 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TROQ12816 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TROQ12816 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TROQ12816 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
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