Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 REC102YLR329W 795 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 RPL7BYPL198W 735 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 BMT2YBR141C 1014 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 SUP45YBR143C 1314 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 HRQ1YDR291W 3234 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 MID1YNL291C 1647 nt5.37□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YJR061WYJR061W 2808 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 IWR1YDL115C 1062 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YGL214WYGL214W 486 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 LEU5YHR002W 1074 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 GAT4YIR013C 366 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 JLP1YLL057C 1239 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 UPS2YLR168C 693 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 PNP1YLR209C 936 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YLR317WYLR317W 435 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 RPC34YNR003C 954 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 JID1YPR061C 906 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 OPY2YPR075C 1083 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 TDA11YHR159W 1515 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 DOA1YKL213C 2148 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 PUF3YLL013C 2640 nt5.36□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 NOT3YIL038C 2511 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 NPL4YBR170C 1743 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YDR391CYDR391C 699 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 RPN9YDR427W 1182 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 DOG2YHR043C 741 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 DOG1YHR044C 741 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 MRPL17YNL252C 846 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 SME1YOR159C 285 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YMC1YPR058W 924 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YPR123CYPR123C 435 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 MUD1YBR119W 897 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 OCT1YKL134C 2319 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 RGT1YKL038W 3513 nt5.35□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 PRP43YGL120C 2304 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 MHF2YDL160C-A 243 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 SUR2YDR297W 1050 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 MRPL16YBL038W 699 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 MAP2YBL091C 1266 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 MRPS16YPL013C 366 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 YPR177CYPR177C 372 nt5.34□□□□□ -1.55
SRP1Q02821 FOL1YNL256W 2475 nt5.34□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 SFI1YLL003W 2841 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 HUL4YJR036C 2679 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 SIP5YMR140W 1470 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 SPO1YNL012W 1896 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 MSA1YOR066W 1890 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 EXG1YLR300W 1347 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 NBP2YDR162C 711 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 BTT1YDR252W 450 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 RPT3YDR394W 1287 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YFH7YFR007W 1062 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 NPY1YGL067W 1155 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YGL204CYGL204C 306 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 PRP18YGR006W 756 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 MRS1YIR021W 1092 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YIR042CYIR042C 711 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 COS9YKL219W 1224 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 INP1YMR204C 1263 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YOR314WYOR314W 330 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 CPS1YJL172W 1731 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 KCC4YCL024W 3114 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 MRK1YDL079C 1506 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 TRE1YPL176C 2352 nt5.33□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YHR202WYHR202W 1809 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 STB2YMR053C 2553 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 PGK1YCR012W 1251 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YEL010WYEL010W 351 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 TMT1YER175C 900 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 PRP38YGR075C 729 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 AIM19YIL087C 474 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YLR125WYLR125W 411 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 MRPL22YNL177C 930 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 ATG5YPL149W 885 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 ATG12YBR217W 561 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 ERT1YBR239C 1590 nt5.32□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 ERG4YGL012W 1422 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 GPR1YDL035C 2886 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 BET1YIL004C 429 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 CAB2YIL083C 1098 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 CIN4YMR138W 576 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 TRI1YMR233W 681 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 PPG1YNR032W 1107 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 AAD15YOL165C 432 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 snR11snR11 258 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 ARR3YPR201W 1215 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 TGL4YKR089C 2733 nt5.31□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 ACC1YNR016C 6702 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 TNA1YGR260W 1605 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 PST1YDR055W 1335 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 HRK1YOR267C 2280 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 ERJ5YFR041C 888 nt5.3□□□□□ -1.56
SRP1Q02821 ARC1YGL105W 1131 nt5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms