Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RACK1P63244 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RACK1P63244 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RACK1P63244 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RACK1P63244 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RACK1P63244 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RACK1P63244 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RACK1P63244 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RACK1P63244 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RACK1P63244 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RACK1P63244 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RACK1P63244 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RACK1P63244 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RACK1P63244 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms