Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP4P57796 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP4P57796 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP4P57796 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP4P57796 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP4P57796 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP4P57796 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP4P57796 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP4P57796 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP4P57796 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP4P57796 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP4P57796 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP4P57796 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP4P57796 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP4P57796 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP4P57796 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP4P57796 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP4P57796 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP4P57796 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP4P57796 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP4P57796 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP4P57796 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP4P57796 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP4P57796 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP4P57796 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP4P57796 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP4P57796 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CABP4P57796 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CABP4P57796 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CABP4P57796 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CABP4P57796 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CABP4P57796 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP4P57796 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP4P57796 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP4P57796 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP4P57796 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CABP4P57796 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CABP4P57796 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CABP4P57796 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP4P57796 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP4P57796 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP4P57796 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP4P57796 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP4P57796 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP4P57796 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP4P57796 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CABP4P57796 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CABP4P57796 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP4P57796 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP4P57796 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CABP4P57796 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms