Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BACE1P56817 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BACE1P56817 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BACE1P56817 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BACE1P56817 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BACE1P56817 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BACE1P56817 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BACE1P56817 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BACE1P56817 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BACE1P56817 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BACE1P56817 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BACE1P56817 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BACE1P56817 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BACE1P56817 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BACE1P56817 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BACE1P56817 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BACE1P56817 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BACE1P56817 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BACE1P56817 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BACE1P56817 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BACE1P56817 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BACE1P56817 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BACE1P56817 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BACE1P56817 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BACE1P56817 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BACE1P56817 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BACE1P56817 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BACE1P56817 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BACE1P56817 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BACE1P56817 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BACE1P56817 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BACE1P56817 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms