Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CtskP55097 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtskP55097 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtskP55097 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtskP55097 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtskP55097 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtskP55097 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtskP55097 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtskP55097 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CtskP55097 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CtskP55097 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtskP55097 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtskP55097 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtskP55097 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtskP55097 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtskP55097 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CtskP55097 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CtskP55097 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CtskP55097 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtskP55097 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtskP55097 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CtskP55097 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtskP55097 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtskP55097 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtskP55097 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CtskP55097 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CtskP55097 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtskP55097 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtskP55097 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtskP55097 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtskP55097 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CtskP55097 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms