Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Aqp4P55088 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Aqp4P55088 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Aqp4P55088 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms