Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab2aP53994 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab2aP53994 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab2aP53994 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms