Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efnb1P52795 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efnb1P52795 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms