Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC34P49427 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC34P49427 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC34P49427 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC34P49427 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC34P49427 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC34P49427 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC34P49427 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC34P49427 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC34P49427 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDC34P49427 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDC34P49427 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC34P49427 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC34P49427 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC34P49427 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC34P49427 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC34P49427 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC34P49427 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms