Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCAR3P49019 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCAR3P49019 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms