Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AboP38649 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AboP38649 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AboP38649 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AboP38649 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AboP38649 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AboP38649 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AboP38649 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AboP38649 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AboP38649 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AboP38649 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AboP38649 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AboP38649 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AboP38649 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
AboP38649 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AboP38649 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AboP38649 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AboP38649 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AboP38649 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AboP38649 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AboP38649 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AboP38649 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AboP38649 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AboP38649 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms