Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ggta1P23336 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ggta1P23336 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ggta1P23336 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms