Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vpreb2P13373 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms