Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOP08100 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOP08100 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOP08100 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOP08100 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOP08100 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOP08100 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOP08100 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOP08100 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOP08100 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOP08100 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOP08100 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOP08100 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOP08100 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOP08100 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOP08100 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOP08100 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOP08100 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOP08100 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOP08100 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOP08100 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOP08100 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOP08100 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOP08100 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOP08100 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOP08100 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOP08100 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms