Protein–RNA interactions for Protein: P01588

EPO, Erythropoietin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOP01588 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOP01588 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOP01588 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPOP01588 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPOP01588 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOP01588 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOP01588 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOP01588 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOP01588 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOP01588 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOP01588 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOP01588 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPOP01588 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPOP01588 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPOP01588 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPOP01588 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPOP01588 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPOP01588 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPOP01588 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPOP01588 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPOP01588 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPOP01588 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPOP01588 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPOP01588 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPOP01588 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPOP01588 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms