Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HIP1O00291 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HIP1O00291 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HIP1O00291 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HIP1O00291 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HIP1O00291 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HIP1O00291 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HIP1O00291 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIP1O00291 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIP1O00291 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIP1O00291 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HIP1O00291 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HIP1O00291 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms