Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm21887J3QQ04 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms