Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GabreA2AMW3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GabreA2AMW3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GabreA2AMW3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms