Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PDE9A-211ENST00000398232 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 CSH1-202ENST00000329882 1073 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC026461.4-201ENST00000379816 242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 RPL36P20-201ENST00000423702 319 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 LINC00337-202ENST00000441724 1138 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AL031432.1-201ENST00000455902 988 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TRAV33-201ENST00000557514 338 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 CLEC4M-210ENST00000597522 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 CYTH4-202ENST00000402997 633 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 CIDECP-205ENST00000433871 770 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ZNRD1-202ENST00000359374 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 LINC01324-202ENST00000497379 838 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC004803.1-202ENST00000545629 569 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ABHD17AP7-201ENST00000569060 595 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM208BQ5VWN6 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms