Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd2Q9Z2E1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mbd2Q9Z2E1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.3 ms