Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC42EP3Q9UKI2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms