Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STN1Q9H668 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STN1Q9H668 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms