Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rhox2aQ9D4Y3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox2aQ9D4Y3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox2aQ9D4Y3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms