Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramef12Q9D2F1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramef12Q9D2F1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef12Q9D2F1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms