Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ube2fQ9CY34 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2fQ9CY34 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2fQ9CY34 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms