Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl11Q9CXW4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl11Q9CXW4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms