Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930535I16RikQ9CUI2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms