Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB3IPQ96QF0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3IPQ96QF0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms