Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRELD1Q96HD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRELD1Q96HD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms