Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vps4aQ8VEJ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vps4aQ8VEJ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms