Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CADM4Q8NFZ8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms